Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MMP12P39900 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms