Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGAEP38570 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms