Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FDFT1P37268 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms