Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPA3P35244 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPA3P35244 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPA3P35244 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPA3P35244 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms