Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GJA4P35212 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms