Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CASQ1P31415 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASQ1P31415 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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