Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ALDH4A1P30038 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms