Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DNMT1P26358 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DNMT1P26358 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms