Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNNA2P26232 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms