Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDSP20132 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDSP20132 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDSP20132 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDSP20132 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDSP20132 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SDSP20132 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDSP20132 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms