Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ITGA4P13612 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms