Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCG2P13521 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCG2P13521 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCG2P13521 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SCG2P13521 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms