Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CBSLP0DN79 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms