Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRSS56P0CW18 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRSS56P0CW18 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms