Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00032P0C843 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms