Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
PKHD1P08F94 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PKHD1P08F94 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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