Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRCP08575 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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