Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPRAP08240 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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