Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOA4P06727 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms