Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
IGKV4-1P06312 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms