Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RAPGEF3O95398 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAPGEF3O95398 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
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