Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COBLO75128 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COBLO75128 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COBLO75128 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COBLO75128 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COBLO75128 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COBLO75128 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COBLO75128 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COBLO75128 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COBLO75128 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms