Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SGTAO43765 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms