Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP290O15078 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP290O15078 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP290O15078 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms