Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRRM5B3KS81 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRRM5B3KS81 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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