Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms