Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF839A8K0R7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms