Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SOBPA7XYQ1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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