Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSDA5PKW4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSDA5PKW4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms