Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CFAP69A5D8W1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CFAP69A5D8W1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms