Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms