Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTPDC1A2A3K4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms