Protein–RNA interactions for Protein: A0AV02

SLC12A8, Solute carrier family 12 member 8, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A8A0AV02 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC12A8A0AV02 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC12A8A0AV02 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms