Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms