Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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HDGFL3Q9Y3E1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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HDGFL3Q9Y3E1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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HDGFL3Q9Y3E1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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