Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UTP11Q9Y3A2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms