Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms