Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNOT6Q9ULM6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms