Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms