Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STAG3Q9UJ98 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms