Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RRBP1Q9P2E9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms