Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HCN3Q9P1Z3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HCN3Q9P1Z3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HCN3Q9P1Z3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HCN3Q9P1Z3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HCN3Q9P1Z3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HCN3Q9P1Z3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HCN3Q9P1Z3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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