Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms