Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms