Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
THUMPD1Q9NXG2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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