Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRX2Q9BZI1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms