Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM54Q9BYV2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms