Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms