Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRIP3Q9BW71 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms