Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms